Brest-Litovsk Antlaşması ile kurulan sınırları ihlal eden Türk birlikleri İlkbahar 1918’de Transkafkasya’yı işgal ettiler. Yeni kurulan Azerbaycan Demokratik Cumhuriyeti Hükümeti’nin bilgisi ve izniyle, Mayıs ayı sonunda Bakü cephesindeki Türk kuvvetlerinin toplam sayısı 20.000’i aştı, 2.000 Kürt müfrezesi de daha sonar katıldı. 31 Temmuz'da, Nuri Paşa liderliğindeki Kafkas Müslüman Ordusu büyük çaplı bir saldırı başlattı, ve 14-15 Eylül gecesi Bakü’yü işgal ettiler. Danimarka ve İran konsoloslarına verilen Ermenilerin güvenliğine dair teminatlara ragmen, 15-17 Eylül tarihlerinde Bakü'de türk subayların ve Müsavat hükümeti içişleri bakanı Han-Civanshir komutasındaki, Türk düzenli ordusu ve çevre köylerin Tatarlarının katılımıyla, üç gün boyunca; 15-17 Eylül, Bakü’de binlerce Ermeni katledildi ve malları yağmalandı.

Bakü katliamının ilk kurbanları, doktorlar, mühendisler, avukatlar, eğitimciler, yazarlar, gazeteciler ve diğerleri dahil olmak üzere yerel aydınlar oldu. Üç gün süren korkunç katliam, yıkım ve yağmalardan neredeyse hiçbir Ermeni aile kurtulamadı. Bazıları kendi evlerinde, diğerleri sokaklarda ve barınaklarda katledildi. Özellikle Ermeni bölge tamamen tahrip edildi.

Çocukları ve hastaları bile esirgemediler, Balakhanı hastanesinde 360 hasta öldürüldü ve Komandantsky Caddesi’ndeki bir yetimhanede 63 çocuk dördüncü kattan aşağa atıllar. Katliamlar Bakü'’en çok uzak olmayan “Nobel Kardeşler” şirketine ait bir yazlık evde devam etti; oraya sığınan 200’den fazla Ermeni öldürüldü. Katliamların izlerini gizlemek için farklı mahallelerden toplanan Ermenilerin cesetlerinin çoğu, denize atıllar veya ateşe verdiler. Katliamın dördüncü gününde Han-Civanshir’in emriyle 9.000 genç Ermeni Muğan çölünde ağır işlere gönderildi ve sadece 400’ü geri dönebildi.

Katliama tanık olan Bakhshi Ishkhanyan başkanlığındaki Bakü Ermeni Milli Meclis’e bağlı “Araştırma Komisyonu” istatistiklerine göre, Bakü düşmeden önce Ermeni nüfusu 88.673 idi. Türk-Tatar güçleri tarafından işlenen soykırımın toplam kurban sayısı 29.063 idi.

1918 Bakü’deki katşıamlar, Osmanlı İmparatorluğu’nda Ermenilere karşı planlanan soykırımın bir devamıydı. Katliam և şiddetinin korkunç olaylarına birçok ordu, gazeteci, diplomat ve hayatta kalanlar tanık oldu ve kaydetti.

Not: 15 Temmuz 1921’de Bihbud Han Civanshir’den, Azerbaycan’ın çeşitli yerlerinde binlerce Ermeni’nin ölümünden sorumlu olan eski Azerbaycan Cumhuriyeti Bakanı Konstantinopolis’te sağ kurtulan genç Ermeni Misak Torlakian tarafından öldürüldü. Davası, 1921 sonbaharında Konstantinopolis’teki İngiliz askeri mahkemesinde gerçekleştirildi. Mahkeme kararıyla Misak Torlakian serbest bırakıldı.